T2T 完美基因组测序

T2T 基因组指组装无 gap 的端粒到端粒基因组（在 rDNA、性染色体、着丝粒中可能允许少量 gaps）；在原始数据与组装之间具有较小的结构性错误，并具有较高的 Q 值（准确性）与 BUSCO（完整性）。

应用方向

• 获得高质量参考基因组，服务领域同行研究。
• 支撑近着丝粒与复杂重复区域研究。
• 为农艺性状或疾病研究提供新线索。
• 揭示「暗黑区域」与未知重复序列。

测序策略示例

例如：60× HiFi + 100× Ultra-long ONT（N50 > 100K）+ 50× 二代 + 100× Hi-C——HiFi 用于高质量骨架；Ultra-long ONT 用于超长 Contig；Hi-C 用于染色体挂载；多数据整合与互相 Merge 以提升 T2T 级别完整性。

质量评估

组装完成后建议进行 BUSCO、一致性评估、QV、与已发表最佳版本共线性比较（如 Mummer）、着丝粒与端粒预测等；必要时配合 PCR、FISH 或 ChIP-seq 验证。

适用物种

动物：哺乳动物、淡水鱼类（需详细评估）、部分海洋动物（先评估）。植物：如 3G 以内常规物种（芝麻、玉米、大豆、棉花等）。特殊物种：部分异源多倍体（棉花、油菜等）需个案评估。